Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc9a3r1P70441 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc9a3r1P70441 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms