Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cux2P70298 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cux2P70298 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux2P70298 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms