Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprvP70289 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprvP70289 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprvP70289 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprvP70289 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprvP70289 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms