Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgif1P70284 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms