Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54lP70270 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms