Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cntn5P68500 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cntn5P68500 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms