Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkcbP68404 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms