Protein–RNA interactions for Protein: P63318

Prkcg, Protein kinase C gamma type, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcgP63318 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcgP63318 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcgP63318 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms