Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms