Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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