Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Crabp1P62965 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Crabp1P62965 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Crabp1P62965 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Crabp1P62965 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Crabp1P62965 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Crabp1P62965 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crabp1P62965 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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