Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbpl1P62340 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms