Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd2P62317 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms