Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snrpd1P62315 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snrpd1P62315 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms