Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps13P62301 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps13P62301 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms