Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ufm1P61961 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufm1P61961 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms