Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SnnP61807 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnnP61807 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SnnP61807 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SnnP61807 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnnP61807 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnnP61807 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnnP61807 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms