Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms