Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Polr3bP59470 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3bP59470 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms