Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdhd1P59328 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdhd1P59328 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms