Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Senp1P59110 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Senp1P59110 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms