Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tpm2P58774 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tpm2P58774 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms