Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Paxbp1P58501 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms