Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtnsP57757 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms