Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samsn1P57725 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms