Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp3P57722 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcbp3P57722 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms