Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp25P57080 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp25P57080 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms