Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bace1P56818 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bace1P56818 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms