Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TdgP56581 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TdgP56581 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TdgP56581 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TdgP56581 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TdgP56581 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TdgP56581 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TdgP56581 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms