Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp5P56399 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms