Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cox17P56394 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms