Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fdft1P53798 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms