Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cux1P53564 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cux1P53564 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms