Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Upp1P52624 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Upp1P52624 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms