Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CntfP51642 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CntfP51642 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CntfP51642 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntfP51642 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntfP51642 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntfP51642 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms