Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RoraP51448 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RoraP51448 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RoraP51448 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RoraP51448 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms