Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ArsaP50428 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ArsaP50428 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms