Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmod1P49813 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod1P49813 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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