Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psen1P49769 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psen1P49769 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms