Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdk5P49615 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk5P49615 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms