Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtpreP49446 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpreP49446 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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