Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptx3P48759 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms