Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GdnfP48540 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GdnfP48540 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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