Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prox1P48437 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms