Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox2P48432 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms