Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Abcd1P48410 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms