Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl5P47962 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms