Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms