Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pax7P47239 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms