Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nedd4P46935 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nedd4P46935 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms